越來越多咖啡愛好者自行買烘培好的咖啡豆回家儲存、自己現磨沖泡，但是最好將『保存期限』盡量縮短。
影響咖啡豆保存有三項因素：溫度，濕度與氧化速度。
林哲豪建議，想要品嚐好咖啡，最好買新鮮烘焙的咖啡豆，烘焙後一週～兩週內會是咖啡最好的品嚐時刻，最多放到一個月，存放越久越容易氧化走味，甚至出現油耗味，風味相對沒那麼好喝。
NG行為1：把咖啡豆裝在透明密封罐中讓光線曝曬
剛烘好豆子一定要存放在陰涼處。研磨後的咖啡香氣分子容易揮發掉，而咖啡的保存長短跟包裝技術有關，目前常見的包裝是密封袋或是單向排氣閥的袋子，單向排氣袋比較能減緩氧化速度，
同樣的，有些人習慣把咖啡豆放在密封罐裡，不透光的罐子也會比透明的罐子好，可以避免光線照射，減緩芳香物揮發與氧化速度。
NG行為2：把咖啡豆放冰箱避免發霉
此外，咖啡豆千萬不要放在冰箱保存，不論是冷藏還是冷凍。
原因是當你從相對溫度低的冰箱拿咖啡豆出來，室溫與袋內溫度有差別，水氣會附著在袋子表面，打開後水氣會再進入，放回冰箱反而會回潮，若要放冰箱保存最好分裝使用，一包就是一次使用的份量。
NG行為3：買聞起來有油耗味的豆子
看咖啡店存放的豆子新不新鮮，可以看透明容器外觀是否有附著一層油脂，而熟豆深烘焙的咖啡豆會有油光，放久會乾掉，淺烘焙的咖啡剛好相反，放久了油光會跑出來。有油耗味的咖啡也表示存放過久。
另外，咖啡豆的新鮮度可以在「Hand Drip手沖」時候觀察：相對不新鮮的咖啡手沖時候，氣泡少，咖啡粉會往下陷，因為豆子裡的二氧化碳在研磨後揮發更快，氧化速度增加，結構產生變化，注水時浮起的氣泡相對少量。研磨後的濾掛包咖啡更容易看出來塌陷。
咖啡豆從後製到運送保存，高溫潮溼環境是滋生「赭麴毒素A」的溫床，在進口的玉米跟大豆運輸過程中也會產生，
《咖啡學》一書作者韓懷宗強調：「你會看不出來咖啡上有赭麴毒素A，毒素就是黴菌生長代謝的東西，吃到黴菌並不會致死。」
一般商業用咖啡生豆大部份從中美洲到日本儲存運送，放一陣子再過來台灣，大約會花二至三個月的時間，如果放在船艙底部靠近馬達溫度較高就容易產生赭麴毒素A，假使運送過來沒問題，夏天堆在倉庫也容易受潮。
要選購安心的咖啡豆，可以從鄰近生活範圍找店家，跟自家烘豆的店老闆做交流購買。
台灣自家烘焙咖啡館的密度是全球數一數二地高，選擇新鮮烘焙的咖啡豆相對方便，「相對於國外大量烘焙製造商進口包裝咖啡豆，小型烘焙業者提供週轉率高的豆子越新鮮，」林哲豪說。
保存咖啡豆Tips：
1.購買時挑選小型包裝，不要囤積豆子，喝多少買多少，盡量加速週轉。
2.烘焙好的咖啡豆保存期限不超過一個月。
3.保存在單向排氣法的豆袋比放在壓縮罐子好，可選不透光的罐子放在陰涼處。
4.若要放冰箱請分裝獨立小袋，分裝一次喝的份量即可。
名詞小辭典：赭麴毒素（Ochratoxin A）
是由青黴菌與麴菌所分泌的二級代謝產物（Secondary metabolites）也就是次級代謝物，具腎臟毒性、免疫抑制性、致癌性等，屬 2B 類致癌物。 食藥署在部授食字第 1021350146 號令修正食品中真菌毒素限量標準，將烘培咖啡豆及咖啡粉中赭麴毒素 A 限量標準訂為 5 ppb 以下，與國際食品法典委員會(Codex)、歐盟和中國相同。為民眾食品安全把關，食藥署 104年 1-7 月抽驗烘焙咖啡豆及咖啡粉共計 87 件，無赭麴毒素 A 超標，皆符合規定。
資料來源：食藥署藥物食品安全週報2016/3/2
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